Pepanthan Godean untuk pertama kalinya mengadakan kebaktian pada tanggal 31 Oktober 1978 di rumah bapak Slamet HS, selatan Balai Desa Sidoagung. Pada tahun 1980 kebaktian pindah di rumah Bapak Siswanto, dan tahun 1983 kembali lagi ke rumah Bapak Slamet. Mereka berhasil menempati gedung gereja baru yang dibangun di atas tanah seluas 100m2 (selatan lapangan Godean) persembahan dari Bapak Slamet pada tanggal 25 Desember 1995.